Problemi con SSH : i file non vengono eliminati

Buongiorno a tutti, ho un problema relativo all’utilizzo di SSH per iphone 16gb jb fw.4.0.1
Ho una repository in Cydia che devo eliminare assolutamente, poichè ogni volta che avvio il programma, mi manda in tilt tutto, impedendomi di scaricare i pacchetti, vedere i programmi installati etc etc.
Sono entrato così nel mio terminale tramite ssh, mettendo indirizzo ip che trovo a lato della mia connessione wi-fi, come nickname utilizzo root e come password alpine.
Il collegamento lo effettuo con Cyberduck, tramite collegamento sftp; tutto procede a meraviglia, riesco ad entrare, trovo la repo, la elimino, riavvio cydia da iphone e tutto va alla grande!
Appena esco da cyberduck a lavoro ultimato, cydia impazzisce nuovamente, la repository cancellata torna magicamente e se mi riconnetto a cyberduck, mi ricompare nuovamente dove era all’inizio…
Ora volevo sapere che procedimento devo seguire per far si che ciò non accada, sembra quasi che non mi salva le modifiche che effettuo.
Spero in una vostra risposta, non so proprio dove sbaglio.
Grazie a tutti come sempre.

Non vi affollate con le risposte…